本论相应主题摘录
按本论相应主题，摘列别解脱戒、菩萨戒、密乘戒的科判与根本颂。这里只作纲要参读，不表示各栏的分类、条件或方法逐项相同。
编选说明
格里只登原文：有颂的标「根本颂」，只登科判的标「科判纲目」；讲解是本部已核的讲记、释论原句，默认收起，没有就不配。只摘一派、一科的，格里标明范围；一栏独有的子科、后文另讲的，收在「补充展开」里。出处链回课程原段，格下链到分类框看细项。
缘起
讲记合说比如别解脱戒是释迦牟尼佛在鹿野苑为五比丘初转法轮时，制定的戒律；菩萨戒是佛陀在印度鹰鹫山为众多菩萨制定的戒律；密乘戒是佛陀在不定的处所，为密宗信士广转法轮过程中制定的戒律。
三戒要解（上）讲解06
别解脱戒 · 缘起
菩萨戒 · 缘起
科判
丁一、真实缘起
根本颂
贤劫众生导师佛，于鹰鹫山等圣地，
为诸大乘种性者，宣说无边广三藏。
文殊结集龙猛释，寂天弘扬深见派，
弥勒菩萨作结集，无著世亲作诠释，
阿底峡弘广行派，莲师自宗同龙猛。
密乘戒 · 缘起
科判
丁一、真实缘起
根本颂
本师普贤金刚持，密严刹中说续部，
后于米积等重说，问者金刚手结集，
八位大成就者等，印藏智者作诠释，
共称前译派教藏，以及新派之宗轨，
虽不可量然于此，宣说续部总誓言。
戒的本体
讲记合说所谓的三种戒律，不害众生是别解脱戒的本体；利益众生是菩萨戒的本体；以特殊方便摄持不害众生和利益众生二者，即为密乘戒的本体。
三戒要解（上）讲解05
别解脱戒 · 戒的本体
科判
丁二、所受戒之本体
根本颂
本体出离意乐引，断除一切害他事，
身语所生之缘故，承许其为有色法，
许断心续与种子，自部上下各观点。
展开讲解1 句
别解脱戒的本体是以出离心的意乐所引发、断除一切害他之事的严禁恶行戒、欲界所摄的一种戒律，因为是出离心所生而遣除了外道的戒律；因断害他而遣除了中间律仪；因为欲界所摄而遣除了禅定与无漏的戒律。
菩萨戒 · 戒的本体
科判
丁二、所得戒之本体
根本颂
本体慈悲润相续，以及为利他众生，
欲求获得菩提故，断除三门罪之心。
展开讲解1 句
若问：菩提心的本体是什么呢？以对无量众生悦意的慈心与不忍他们痛苦的悲心滋润相续，唯一为了利益他众以智慧缘圆满菩提而想获得佛果之心引发，也就是以智慧方便双运的愿行心所摄六度本体的特殊发心，断除利他之障碍以及自己圆满菩提之违缘三门罪业的相续心。
密乘戒 · 戒的本体
科判
丁二、所受戒之本体
根本颂
本体三门由方便，智摄戒条依各宗。
到课程原段：《自性大圆满支分决定三戒论释》第四品 密乘戒展开讲解1 句
若问：所实修的密乘戒的本体是什么呢？以能护殊胜方便智慧摄持的大乐智慧加以防护所护之三门细微习气以及执相之分别念的心及其种子并且通过自相续获得灌顶而得到的密宗戒律。
分类
别解脱戒 · 分类
分类框八种别解脱戒
菩萨戒 · 分类
科判
己一、分一至六类
根本颂
分类龙猛无著二，每一一至六各二，
一类空性大悲藏，二资胜义世俗二，
三类戒定慧三学，资粮加行信解行，
不净七地胜意乐，三清净地异熟心，
大悲断除一切障，即是佛地发心四，
观待五道五发心，对应六度分六类。
密乘戒 · 分类
未得戒者得受之方法
别解脱戒 · 未得戒者得受之方法
科判
丁一、旧仪轨
根本颂
初未得戒得受法：受法分二旧仪轨：
自然证智传信圆，承认本师许八难，
善来四白问答等，受者心净圣者师。
展开讲解1 句
其中旧仪轨：最初本师成佛之前、成佛之时、成佛后不久以及涅槃之前受近圆戒的仪轨称为旧仪轨。
科判
丁二、现行仪轨
根本颂
现行轨离五择定，石女等生之障碍，
国王不允等住障，不能驱乌等胜障，
以及发为黄色等，庄严障碍皆无有。
展开讲解2 句
继旧仪轨之后制定的白四羯磨仪轨及其从属，即是现行仪轨。
此外，对石女与犯五无间罪等人虽传戒，但他们不能生起戒体，这是生之障碍；由于未得到国王与父母的允许，虽得戒，但因无有自由，故而戒体不能持久，这是住存之障碍；未到驱乌之年，或因病苦缠绕等，虽受戒，但不能守学处，不能学到殊胜功德，这是殊胜之障碍；黄发等色有缺陷者、断手等形有缺陷者以及屠夫等种姓有缺陷者，虽能学戒，但由于成为他众不信仰佛法之因，故是庄严之障碍。
菩萨戒 · 未得戒者得受之方法
龙猛派摘录
科判
戊一、世俗发心依仪轨之受法
根本颂
初未得戒得受法，持戒善知识面前，
大乘法器之信徒，七支供已愿行心，
一次性受自他喜，此乃龙猛之观点。
补充展开 · 无著派
补充展开 · 二派共同
补充展开 · 戊二、胜义发心由修力而得
科判
戊二、胜义发心由修力而得
根本颂
胜义依轨而得受，此乃密宗之观点，
显宗若有如是说，仅是立宗修力生。
展开讲解1 句
胜义发心的法相：现量证悟无分别法性之智慧的菩萨圣者根本慧定以及佛陀入定出定无二无别之本体的发心。
密乘戒 · 未得戒者得受之方法
所护戒条
别解脱戒 · 所护戒条
菩萨戒 · 所护戒条
补充展开 · 戊二（能护之方法）分四：一、以四正断之精进而护持；二、以正知正念不放逸而护持；三、一切威仪中以善法度日而护持；四、以摄一切学处而护持。
科判纲目
戊二（能护之方法）分四：一、以四正断之精进而护持；二、以正知正念不放逸而护持；三、一切威仪中以善法度日而护持；四、以摄一切学处而护持。
到课程原段：《自性大圆满支分决定三戒论释》第三品 菩萨戒生起戒体之所依
别解脱戒 · 生起戒体之所依
科判
丁二、生起戒体之所依
根本颂
生戒所依除外道，造无间罪北俱洲，
黄门两性五黄门，三变性者幻化外，
生于三洲之男女，承许为戒之所依。
展开讲解1 句
生起如是别解脱戒的所依身体：业障深重、外道或入于外道造五无间罪等以及异熟障严重的北俱卢洲地方的众生是失毁种姓者。如云：“无有性别者，称彼为黄门。”
菩萨戒 · 生起戒体之所依
科判
戊三、生起菩萨戒体之所依
根本颂
生戒所依天与龙，罗刹女等罪业者，
亦能生戒龙猛宗，无著则说彼所依，
需具别解脱戒者。总之信仰佛与法，
亦信无上菩提果，信奉如海佛子行，
则能生起菩萨戒，此乃宝灯经中云。
密乘戒 · 生起戒体之所依
失毁与还净
别解脱戒 · 失毁与还净
科判
戊二、真实还净
根本颂
若无覆藏说真实，于僧前忏视戒净，
复受戒律僧残等，观待轻重次第净。
展开讲解1 句
所谓的覆藏，想保密罪业的心理即是覆藏之心，以此引发语言不告诉他人，身体也加以隐瞒，即是覆藏罪，它是有表色，所覆藏罪之本体是无表色。
菩萨戒 · 失毁与还净
龙猛派摘录
科判
丁二（真实还净方法）
戊一、龙猛菩萨之观点
根本颂
越时失毁黎明时，祈祷圣者虚空藏，
梦中堕罪得忏净，余罪昼夜诵三遍，
三聚经而得清净，此乃龙猛之观点。
补充展开 · 无著派
无著派
科判
戊二、圣者无著之观点
根本颂
行四黑法舍众生，则已舍弃愿心戒，
不间断行无惭愧，以此喜悦视为德，
乃大束缚毁戒律，称为他胜小中非。
犯他胜罪重受戒，中等者于三人前，
下等者于一人前，以说罪体而忏悔，
无相合者意念戒，广大行派无伦比。
密乘戒 · 失毁与还净
只摘「对治犯戒之四门或六因」一科
科判
丁一（无堕罪之理）
戊一、对治犯戒之四门或六因
根本颂
末说失而恢复法，不知罪界不敬师，
放逸而行惑多四，犯罪四门无著许。
彼之对治修学处，敬众恒依正知念，
精勤对治大烦恼，如是应当修学彼。
四种所断基础上，复加忘失念不明，
称为失誓之六因，吉祥戒续有明说。
展开讲解2 句
首先应当了知对治犯戒之因的道理，舍戒四因，一、不知罪界：虽想修学誓言但由于不知晓各自堕罪的取舍界限；二、不敬上师：尽管知道却对上师与彼所传的学处等不恭敬；三、放逸而行：虽然恭敬但不见过患或者不具正知正念，因而不小心谨慎，放逸无度，肆意而行，依此作为犯罪之因；四、烦恼粗重：虽生起些许戒备之心，烦恼却十分深重。
在舍戒四因的基础上，再加上忘失学处界限与无有正知、正念不明两种，即称为失毁誓言之六因，对此《吉祥戒续》中有明确宣说。
只摘「观待四灌顶之恢复方法」一科
科判
丁二（真实还净）
戊一、观待四灌顶之恢复方法
根本颂
获七灌顶造每尊，念咒三万六千净，
得瓶密灌行事净，后入坛城受四灌，
获得智慧句灌顶，若失除以生次第，
及无改戒圆次第，加持自续外不净。
分类框五种失誓言
守戒之功德
别解脱戒 · 守戒之功德
菩萨戒 · 守戒之功德
密乘戒 · 守戒之功德
本页只摘各栏相应主题的开头；全文按课次读，到三戒论论页。