当时不像现在有便利的交通工具，法王与土巴背着包袱，一路上翻山越岭，忍饥挨饿，实在支撑不住，就沿途化缘。历尽了千难万险，终于抵达目的地——石渠江玛佛学院。

他不顾旅途劳顿，立刻去觐见上师。托嘎如意宝身材修长，体格清瘦，却十分硬朗，慈眉善目又不失威严，身穿陈旧的僧衣。一见到上师的尊颜，法王顿时生起了无比信心，一切粗大的分别念全然消失，立即上前礼拜，并默默发愿：我一定恭恭敬敬终生以三喜依止上师。之后在恩师前认真全面地接受显密教法，尤其是大圆满的灌顶、传承、窍诀。

他和普通僧人一样，一丝不苟精进求学。住的是十分简陋的草坯房，只能勉强容身、遮风避雨，遇到狂风暴雨就摇摇欲坠，大雪纷飞时，全部被埋在雪中像个大雪堆；无论天寒地冻还是酷暑炎炎，一年四季身上穿的是从尸陀林捡来的破布做成的粪扫衣；止渴果腹的是僧团中分下来的少量酸奶，本来十八九岁的少年正是身体需要营养的时候，法王却仅以此果腹，就像无垢光尊者依止恩师革玛燃匝一样，追随前辈高僧大德的足迹求学。他当时所经历的苦行是常人无法想象的，江玛佛学院的僧人看他竟能如此吃苦，都十分钦佩。

刚到江玛佛学院时，常住僧人都不承认他的智慧。一次他与一位喇嘛关于俱舍中的一问题展开辩论，场面越来越激烈，众多颇有智慧的僧人群起而攻之，一致破斥他的观点。最后法王举出强有力的教证（即《俱舍大疏》中的依据），他们居然不承认，异口同声说没有此教证。于是大家当场翻开大疏，果不其然，法王的观点完全正确，众人不禁心悦诚服，从此对他的智慧佩服得五体投地。