对三宝真正的归依，不仅是内道三乘一切戒的基础，而且也是内道一切功德的基石。
诸有归依佛，及归依法僧，于四圣谛中，恒以慧观察，知苦知苦集，知永超众苦，知八支圣道，趣安隐涅槃，此归依最胜，此归依最尊，必因此归依，能解脱众苦。就是说，归依了佛法僧三宝后，会用智慧观察而通达四圣谛、八圣道，最后获得涅槃安乐。因此对三宝的归依最为殊胜，也最为珍贵，众生归依了三宝后，必然能从众苦中获得解脱。
内道的功德，就是三士道的功德，这些都要通过修行才能获得。比如要获得八种异熟功德、八种异熟果报等，并成就能快速修一切种智殊胜的善妙所依，必须要依靠殊胜的共下士道十善等修行，而此唯有内道中才有正确无误圆满的宣说。同样，要获得中士道的阿罗汉果位，在共下士道的基础上，需要修行四圣谛或十二缘起；要获得上士道的佛果，在共下、中士道的基础上，需要发菩提心、修行六度四摄等这些大乘不共的法要。这些出世功德出生的前提，都是建立在真正归依的基础上的。因此，内道每一法门的修行引导文，必然是以真诚的归依开始。并且正行部分往往只念诵一次，而归依的偈颂则需要念诵三次，这表示只有归依心真正生起后，正行的修法于内心才能如量生起。正因为真正的归依是内道一切功德的基石，所以归依所能产生的福德也就不可思议。如《无垢经》云：“归依之福德，若其具色相，遍满虚空界，彼将胜虚空。”
同样归依心越深厚，产生的功德也越大。如《涅槃经》说：“归依三宝者，速得佛果位。”《集学论》也说：如果一个人时常对三宝恭敬、供养，没有疲厌之心，那他就能超越四魔，很快成就无上菩提。
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