祈祷莲师跟祈祷佛是一模一样的，你信心越强烈，莲师的加持会越迅猛。所以信心是占主要位置，祈祷的时候，真实无伪的信心若自然引发出来，那么佛菩萨的加持必定降临。当然，以散乱的行为来祈祷，其加持也不会虚耗，但力度定然有所差别。
祈祷的方式，我建议大家念《开显解脱道》里的上师瑜伽，它的语句虽然简单，但完整无缺地包含了所有修法，所以特别特别难得。具体而言，在修之前要先皈依、发心，然后开始念上师瑜伽：念诵时自观为金刚瑜伽母，莲师佛父佛母在自己上方，通过猛厉的祈祷，令其加持入于自己心间。先念七句祈祷文来祈祷，接着随力念诵莲师心咒。念完以后，观想上师三处发出三种光融入自身，自己获得了上师身语意的灌顶和加持。最后上师融入一明点，明点融入自己心田，自心跟无二无别的智慧胜义明点融为一体。以前多竹仁波切（单比尼玛的别名）专门有一个祈祷莲师的上师瑜伽，里面讲了很多窍诀，有时间我想给大家简单叙述一下。
在座很多道友，若是出家人，看破红尘来这里长期修学，非常不容易；若是在家人，克服了种种艰难险阻，一心一意地学佛，也非常不简单。外面佛学会的很多人，经常要面临家庭、单位的问题，甚至在发心过程中也有许多磨难，但大家始终不屈不挠、勇往直前，这种精神非常可嘉。然而，这样的行为能保持多长时间？自他都不敢说。毕竟末法时代的散乱与诱惑特别强，凡夫人的心力极其薄弱，故一定要以强有力的上师、本尊、护法作为后盾。因而，大家务必要多持诵莲师心咒、七句祈祷文来修上师瑜伽，若能如此，修行定会善始善终、圆满究竟。这也是我们一生中最大的收获。
我个人而言，什么时候死、什么时候得不好的名声，这些方面并不担忧。唯一关心的是，自己的道心千万不能退；现有的这点功德，不管是微不足道的菩提心，还是对上师三宝的信心，都能日益增上；以前没有的境界尽快生起；凡与我结缘的所有众生，能得到一点一滴利益，这就是我平时所向往的、所希求的。我整个身心打开的话，就是想在短暂的人生中，依靠佛法利益一些众生，就像商人想赚很多钱一样，我就想大家得一点利益。但这个利益，如果你不懂方法，有时候希望是好的，可追求的目标始终达不到。
末法时代，违缘可谓此起彼伏、层出不穷，所以我们要想方设法超越这一切，真正得到诸佛菩萨、金刚上师的加持。对上等者而言，当下要获得开悟；对中等者而言，应该对上师三宝有不退信心，对佛教教义有所领悟；对下等者而言，也要不舍上师三宝，以修行人或出家人的身份圆满度过一生，为来世种下殊胜善根。为了这么一个目的，我今天没有层次地胡言乱语，想什么就说什么。但在自己心里，总觉得祈祷莲花生大士和念莲师心咒很重要，假如你们在这次闭关100天中，把莲师心咒念得很好，确实是难得的一个机缘，所以大家要努力！
摘自《前行广释3》上师瑜伽·祈祷莲师