日本禅宗分三派，即荣西所传之临济宗、道元所传之曹洞宗、隐元隆琦所传之黄檗宗。明治维新之前，三宗总称禅宗，并未别立宗名。明治七年（1874），教部省始立临济、曹洞二宗，而并黄檗宗于临济宗。明治九年，复别立黄檗宗。